Молекулярное моделирование

В этой работе стабильность гомотримерного пептида T3-785 репрезентативной модели человеческого коллагена была описана в энергетических терминах с помощью метода молекулярного фракционирования с сопряженными колпачками (MFCC) и в рамках теории функционала плотности (DFT). Удалось предсказать индивидуальную значимость аминокислот Pro Hyp Gly Ile Thr Gly Ala Arg Gly Leu и Ala последующее значение триад Pro-Hyp-Gly Ile-Thr-Gly Ala-Arg-Gly и Leu-Ala-Gly и наконец влияние N-концевой центральной и C-концевой зон каждой цепи на поддержание целостности тройной спирали коллагена. Чтобы сделать это возможным были рассчитаны силы притяжения и отталкивания 90 остатков составляющих систему. Каждый из этих остатков имел энергию взаимодействия которая менялась в зависимости от химической природы его боковой цепи окружающей его микросольватационной среды и межмолекулярных контактов которые он устанавливал. Новаторское исследование конформационной стабильности свободной области иминокислот с энергетической точки зрения будет способствовать исследованиям направленным на разработку и синтез искусственных коллагенов с высокой стабильностью с помощью биоинженерии.