Секвенирование и генетическая характеристика

Банан (род Musa) - важная экономическая и продовольственная культура. Растения банана подвергаются нападению многих бактериальных грибковых и вирусных патогенов. Одним из наиболее важных вирусных патогенов банана является вирус банановой грозди (BBTV) который вызывает заболевание банановой грозди (BBTD). В Индии банановая промышленность столкнулась с проблемой BBTV с конца 1980-х годов когда сильная эпидемия привела к резким экономическим потерям. Геном BBTV состоит как минимум из шести составных частей молекул циркулярной одноцепочечной ДНК (cssDNA) каждая из которых имеет размер около 1 Кб. BBTV относится к роду Babuvirusin Nanoviridae одному из трех семейств сссДНК-вирусов. Он передается черной банановой тлей Pentalonia nigronervosa Coq. Информация о BBTV в Керале ограничена. Очень важно выделить и охарактеризовать вирус заражающий банановые культуры в Керале. Чтобы охарактеризовать BBTV из Кералы ДНК-R изолята из различных районов Кералы была амплифицирована с помощью ПЦР клонирована и секвенирована. Анализ геномных компонентов DNA-R выявил подгруппы BBTV в Керале. На основании ДНК-Р изоляты из Кералы относятся к южно-тихоокеанской подгруппе.