Компьютерные технологии для создания новых лекарств против ВИЧ

В книге представлены алгоритмы компьютерного конструирования потенциальных лекарственных препаратов на основе данных о структуре молекулярной мишени использующие технологии глубокого обучения in silico клик-химии и молекулярного моделирования. Алгоритмы апробированы в процессе генерации и компьютерного тестирования потенциальных ингибиторов проникновения ВИЧ-1 блокирующих CD4-связывающий сайт белка gp120 оболочки вируса. В рамках концепции in silico клик-химии осуществлен компьютерный дизайн новых ингибиторов проникновения ВИЧ-1 и идентифицированы соединения перспективные для разработки новых эффективных противовирусных препаратов. Методами фармакофорного моделирования обнаружены химические соединений имитирующие структурно-функциональные свойства анти-ВИЧ антитела N6 которое нейтрализует до 98% протестированных штаммов ВИЧ-1 включая 16 из 20 штаммов резистентных к другим антителам взаимодействующим с CD4-связывающим участком белка gp120.