A queima in situ de resíduos de culturas praticada pela maioria dos agricultores no noroeste da Índia deteriora a qualidade do solo e do ambiente. Os fungos têm potencial para a degradação da lenhinocelulose e podem ser utilizados para a decomposição in situ de resíduos de culturas. Foram isoladas espécies de fungos nomeadamente Aspergillus terreus A. flavus A. niger e Penicillium janthinellum que foram avaliadas com base na atividade de enzimas lignocelulolíticas para determinar o potencial de degradação dos resíduos de culturas. A. flavus e A. terreus mostraram 30% de degradação dos resíduos após 10 dias de incubação e estes fungos não mostraram qualquer efeito secundário no crescimento da cultura do trigo em condições de campo. Verificou-se que a diversidade fúngica aumentou com as práticas de gestão baseadas na AC as sequências máximas de filo estavam na ordem de Ascomycota> Basidiomycota> Glomeromycota. No entanto Alternaria Cercophora e Epicoccum foram os géneros de fungos mais abundantes. A nível de filo a abundância relativa de Ascomycota variou de 55 a 74% com a maior dominância registada em sistemas de milho baseados em CA (milho-trigo-mungo) e a menor com arroz-trigo convencional no entanto a nível de classe Sordariomycetes teve a maior abundância seguida de Dothideomycetes e Eurotiomycetes.
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