Trichoderma est un genre de champignons de la famille des Hypocreaceae que l'on trouve dans tous les types de sols et qui est le champignon cultivable le plus commun. Ils sont présents dans le monde entier et peuvent être facilement isolés du sol de la matière organique des plantes du bois en décomposition etc. Il s'agit d'un agent de biocontrôle agressif bien connu qui possède un potentiel élevé de reproduction et de colonisation. Dans cette étude la diversité génétique de quatorze isolats de Trichoderma (TBT- 01 à TBT- 14) a été évaluée à l'aide de dix marqueurs SSR. Des échantillons de sol rhizosphérique provenant de différents endroits de l'Uttar Pradesh ont été prélevés et soumis à une dilution en série et à un ensemencement sur un milieu sélectif de Trichoderma. Les colonies des isolats ont été mises en culture pure sur une gélose dextrose de pomme de terre pour l'isolement de l'ADN et les études moléculaires. Dix amorces SSR (SSR-01 SSR- 06 SSR- 08 SSR- 10 SSR- 11 SSR-13 SSR- 14 SSR- 15 SSR- 18 et SSR- 20) ont été utilisées pour l'amplification PCR de l'ADN isolé.
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