A biologia de sistemas enquanto compreensão e previsão do funcionamento da maquinaria intracelular necessita de novos suportes tecnológicos para observar o metabolismo celular a todos os seus níveis. Desde o genoma do organismo até à sua transcrição passando pelas proteínas e pela forma como estas regulam os pools de metabolitos como resposta final a determinados estímulos são necessários para observar de perto estados metabólicos específicos. A espetrometria de massa é utilizada para obter informação intracelular ao nível da metabolómica peptidómica e proteómica para questões específicas relacionadas com a otimização de bioprocessos.