La presenza di batteri nell'acqua da un lato rappresenta un potenziale rischio per la salute della popolazione e dall'altro dimostra l'adattabilità agli inquinanti chimici che colpiscono l'ambiente.La contaminazione dell'acqua da parte di diversi agenti patogeni richiede la ricerca di alternative per garantirne la potabilizzazione ed evitare malattie gastrointestinali. In questo senso l'uso del cloro è stato fondamentale per inattivare i microrganismi presenti nell'acqua. Tuttavia il suo utilizzo è legato alla potenziale formazione di sottoprodotti tossici che possono rappresentare un rischio per la salute pubblica. D'altra parte i batteri svolgono anche un ruolo importante nella bonifica del suolo e delle acque crescendo e degradando diversi inquinanti come vari idrocarburi (HC).
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