Każdy geolog zastanawia się nad pochodzeniem formacji geologicznej i minerałów które ją tworzą i z których się wywodzi. W formacjach osadowych wiele przykładów minerałów i rud obserwowanych w terenie i badanych w laboratorium ma pochodzenie mikrobiologiczne lub ściśle powiązane a wielu badaczy geologicznych mikrobiologów biologów geochemików i chemików zgadza się obecnie że mikroby mogą odgrywać bezpośrednią rolę w mineralizacji ale przede wszystkim ważną rolę w wychwytywaniu i koncentracji metali. Badania przeprowadzone na niektórych horyzontach węglanowych z ooidami poziomach bogatych w siarczki z górnej jury w Ali Sabieh pseudo-pisolitach i pseudo-żelaznych ooidach z epoki kredy w Ali Sabieh węglanowych trawertynach hydrotermalnych z jeziora Abhé i jeziora Asal oraz kulach solnych z jeziora Asal wykazały mineralizację wynikającą z metabolizmu drobnoustrojów. W latach 1982-1985 badania sedymentologiczne przeprowadzone na środkowokredowych boksytach i trzeciorzędowych żelazofosforanach z Grecji kontynentalnej wykazały bliski związek między stromatolitami ooidami i tymi minerałami.