Descobriu-se que a Bhut Jolokia estava infetada por um complexo de doenças virais causadas por quatro vírus a saber: o vírus do mosaico do pepino (CMV) o vírus Y da batata (PVY) o vírus da necrose do botão do amendoim (GBNV) e o vírus do enrolamento da folha da malagueta (ChLCV). A incidência e a deteção dos vírus foram realizadas com base na sintomatologia no inseto vetor no DAS-ELISA e no PCR. Foi adotada uma abordagem integrada para controlar o complexo de doenças que incluiu vários tratamentos como tratamentos de sementes viveiros e tratamentos no campo principal em diferentes combinações.