Diversité génétique et pathologique des isolats de pourriture rouge au Bangladesh

La pourriture rouge est la maladie la plus destructrice de la canne à sucre au Bangladesh et entraîne des pertes financières importantes pour les producteurs de canne à sucre. Cette étude a été réalisée pour caractériser les isolats de Colletotrichum falcatum de la canne à sucre collectés dans différentes régions du Bangladesh sur la base de caractéristiques morphologiques et moléculaires. Les quatre gènes à savoir l'espacement transcrit interne (ITS-rDNA) la β-tubuline l'actine et la glaceraldéhydes -3 phosphate déshydrogénase (GAPDH) ont montré une similarité de 99 à 100 % avec les séquences de gènes conservés dans la base de données GenBank. L'analyse phylogénétique des quatre gènes a révélé que les isolats de C. falcatum du Bangladesh étaient regroupés dans le même clade et ne présentaient aucune distinction géographique par rapport aux isolats d'autres pays. Les marqueurs ISSR ont déterminé la faible diversité génétique des isolats de C. falcatum au Bangladesh. Les niveaux de virulence des 41 isolats de C. falcatumcorrespondant à la réaction de la maladie sur la plante hôte ont été classés en trois groupes principaux : virulent modérément virulent et peu virulent. Les sept hôtes différentiels de la canne à sucre ont été classés comme résistants modérément résistants et sensibles.