As lagoas são um tipo particular de massa de água de transição na medida em que ocupam um nicho importante entre a terra e o mar entre as características de uma bacia hidrográfica e o oceano aberto. Têm o seu próprio conjunto de processos para além de dependerem de processos provenientes do escoamento de água doce da terra da costa e do mar. No entanto são também locais de grandes desenvolvimentos urbanos e industriais de portos de aquacultura e de pesca. É axiomático que os cientistas das zonas lagunares tenham de inserir o seu trabalho sobre as características naturais no mundo real da gestão administração e governação das zonas. Teremos de lidar cada vez mais com a eutrofização costeira. O desenvolvimento humano ao longo da costa não reduzirá a entrada de nutrientes e de matéria orgânica que é a causa da eutrofização. Temos de estudar estratégias de gestão eficazes a jusante das consequências da eutrofização.
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