Genetische und pathologische Vielfalt von Rotfäule-Isolaten in Bangladesch

Die Rotfäule ist die zerstörerischste Krankheit des Zuckerrohrs in Bangladesch und verursacht große finanzielle Verluste für die Zuckerrohrbauern. Diese Studie wurde durchgeführt um die Colletotrichum falcatum-Isolate von Zuckerrohr die aus verschiedenen Regionen in Bangladesch gesammelt wurden anhand morphologischer und molekularer Merkmale zu charakterisieren. Die Sequenzen von vier Genen nämlich interner transkribierter Spacer (ITS-rDNA) β-Tubulin Actin und Glaceraldehyd-3-Phosphat-Dehydrogenase (GAPDH) zeigten eine 99-100%ige Ähnlichkeit mit den konservierten Gensequenzen in der GenBank-Datenbank. Die phylogenetische Analyse der vier Gene ergab dass die C.falcatum-Isolate aus Bangladesch in derselben Gruppe zusammengefasst waren und sich geografisch nicht von den Isolaten aus anderen Ländern unterschieden. ISSR-Marker zeigten die geringe genetische Vielfalt der C. falcatum-Isolate in Bangladesch. Die Virulenzgrade der 41 C. falcatum-Isolatewurden entsprechend der Krankheitsreaktion auf der Wirtspflanze in drei Hauptgruppen eingeteilt: virulent mäßig virulent und wenig virulent. Die sieben Zuckerrohr-Differenzialwirte wurden als resistent mäßig resistent und anfällig eingestuft.