Genomica comparativa di Salmonella spp mediante PFGE

Salmonella spp. è uno dei più importanti patogeni alimentari studiati in tutto il mondo. La salmonella causa malattie tifoidee e non tifoidee nell'uomo e negli animali. La parentela genetica degli isolati è stata correlata utilizzando il software bioinformatico Applied Math. Per l'isolamento dei batteri è stato utilizzato un metodo standard di isolamento della salmonella. Le colonie provenienti dalle piastre microbiche sono state confermate utilizzando i kit di rilevamento MicroSEQ Salmonella spp. e la macchina Step One Plus RT PCR di Applied Biosystems. Un dendrogramma genetico è stato generato utilizzando il software Applied Math dai gel PFGE generati dalla digestione Xbal dei ceppi e utilizzando Salmonella braenderup (H9812) come ceppo di riferimento. La tecnica è stata utile per correlare i ceppi batterici provenienti da pollame e campioni ambientali.