Genomika porównawcza i strategie projektowania leków

Malaria stanowi zagrożenie dla ludzkości i jest przyczyną milionów przypadków zachorowań i zgonów na całym świecie. Za wywoływanie choroby odpowiada pasożyt Plasmodium. Niniejsza praca bada i ujawnia ukryte informacje zawarte w genomach pasożytów przy użyciu analizy porównawczej genomów i badania tendencji w użyciu kodonów. Sprawdzono możliwość wykorzystania zmiennych białek powierzchniowych jako wspólnego celu dla leków zarówno w przypadku gatunków Plasmodium zakażających ludzi jak i stwierdzono że zmienne białka powierzchniowe nie mogą być wykorzystywane jako wspólny cel dla leków ze względu na istnienie różnic sekwencyjnych i strukturalnych zarówno na poziomie genomu jak i proteomu. W niniejszej pracy wykorzystano również informacje dotyczące sieci metabolicznej w celu identyfikacji nowych celów terapeutycznych. W celu znalezienia prototypów leków wykorzystano również inne podejścia in silico tj. modelowanie molekularne generowanie trójwymiarowych modeli farmakoforów opartych na strukturze wirtualną selekcję i dokowanie itp.