O ensino superior desempenha um papel fundamental no desenvolvimento económico de um país em termos de satisfação das demandas da sociedade. A qualidade no ensino superior tem sido um tema recorrente nos últimos anos especialmente após a criação do Sistema Nacional de Avaliação do Ensino Superior (SINAES). Assim este estudo tem como objetivo analisar o IGC de universidades públicas e privadas das cinco regiões brasileiras a fim de descrever o desempenho das IES por região identificar possíveis discrepâncias intrarregionais e interregionais e sugerir oportunidades de melhoria. Os resultados mostraram que as universidades públicas superaram as privadas em todas as regiões particularmente nas regiões norte e sudeste. Em relação à variabilidade as universidades privadas tiveram o melhor desempenho nas regiões centro-oeste e sudeste. No que diz respeito à variabilidade as universidades privadas tiveram o melhor desempenho nas regiões Centro-Oeste e Norte do Brasil. No entanto uma avaliação completa do desempenho das IES por região requer uma análise integrativa dos resultados do IGC alinhada com outros subsistemas de avaliação que integram a avaliação multidimensional do SINAES.