Génomique comparative de Salmonella spp à l'aide de la PFGE

Salmonella spp. est l'un des principaux agents pathogènes alimentaires étudiés dans le monde. Salmonella provoque des maladies typhoïdiques et non typhoïdiques chez l'homme et l'animal. La parenté génétique des isolats a été corrélée à l'aide du logiciel bioinformatique Applied Math. Une méthode standard d'isolement des salmonelles a été utilisée pour l'isolement des bactéries. Les colonies provenant des plaques microbiennes ont été confirmées à l'aide des kits de détection MicroSEQ Salmonella spp. et de la machine RT PCR Step One Plus d'Applied Biosystems. Un dendrogramme génétique a été généré à l'aide du logiciel Applied Math à partir des gels PFGE générés par la digestion Xbal des souches et en utilisant Salmonella braenderup (H9812) comme souche de référence. Cette technique a permis de corréler les souches bactériennes provenant de volailles et d'échantillons environnementaux.