Identifizierung von mit HMGA2 interagierenden Proteinen

Diplomarbeit aus dem Jahr 2009 im Fachbereich Biologie - Genetik / Gentechnologie Note: 19 Universität Bremen (Zentrum für Humangenetik) Sprache: Deutsch Abstract: Das HMGA2-Protein gehört zur Familie der HMG-Proteine (High Mobility Group-Proteine) welche ihren Namen aufgrund der hohen Laufgeschwindigkeit in der Polyacrylamidgelelektrophorese erhalten hat (Tallini u. Dal Cin 1999). HMG-Proteine wurden 1973 von Goodwin et al. erstmals entdeckt und beschrieben. Sie sind Chromatin assoziierte Nicht-Histon-Proteine die als architektonische Transkriptionsfaktoren an AT reiche Regionen der DNA binden können (Bustin u. Reeves 1996). HMG-Proteine können den Aufbau von Kernprotein-Strukturen welche an der Transkription der Replikation sowie der Chromatin-Konformation beteiligt sind beeinflussen. Dies geschieht mit Hilfe eines komplexen Netzwerks von Protein-DNA- und Protein-Protein-Interaktionen (Ferguson et al. 2003). Aufgrund ihrer Funktion als Transkriptionsregulatoren spielen HMG Proteine eine wichtige Rolle bei einer Vielzahl von Erkrankungen die auf Mutationen beruhen welche die chromosomalen Regionen der entsprechenden Proteine betreffen. HMG-Proteine zeichnen sich durch einige gemeinsame chemische und physikalische Eigenschaften aus. Sie können vom Chromatin mit 035 M NaCl extrahiert werden besitzen eine molekulare Masse kleiner als 30 kDa sind löslich in 5% Perchlorsäure sowie Trichlorsäure und weisen einen hohen Anteil an geladenen Aminosäuren auf (Johns 1982; Cleynen u. Van de Ven 2007). Die Familie der HMG-Proteine besteht aus den drei Subfamilien A B und N die sich aufgrund charakteristischer funktioneller Sequenzmotive voneinander unterscheiden (Catez et al. 2004; Flohr et al. 2003; Prymakowska-Bosak et al. 2001). Die Interaktion zwischen HMG-Proteinen und DNA bzw. Chromatin erfolgt mit Hilfe dieser Sequenzmotive. Bezeichnend für die jeweilige Bindungsdomäne ist der letzte Buchstabe der Subfamilien. Die Bindungsdomäne der HMGA-Proteine