Immunoewolucja podtypu A wirusa HIV w zróżnicowanych genetycznie kohortach

Ludzki wirus niedoboru odporności typu 1 (HIV-1) szybko mutuje pod wpływem presji selekcyjnej ze strony odporności gospodarza co pozwala na amplifikację mutacji ucieczkowych które umożliwiają wirusowi uniknięcie odpowiedzi immunologicznej gospodarza. Najwcześniejsze identyfikowalne sekwencje HIV-1 podtypu A (w repozytorium sekwencji) pochodziły z Afryki z około połowy lat 80-tych. W kolejnych latach wraz z globalnym rozprzestrzenianiem się wirusów podtypu A zaczęły pojawiać się również sekwencje z różnych części świata. W ciągu ostatnich kilku dekad podtyp A wirusa HIV-1 zadomowił się w niektórych regionach świata w tym w Kenii Ugandzie Japonii Azerbejdżanie Belgii Botswanie Białorusi Kongo a ostatnio w Afganistanie i Pakistanie. Analiza wzorców ewolucyjnych wirusa w kontekście populacji jego gospodarza rzuca światło na presję selekcyjną na wirusy które są związane z określonymi środowiskami immunologicznymi gospodarza. Tego typu informacje są przydatne w projektowaniu szczepionek i leków przeciwko wirusom.