Melhoramento molecular e recursos gen��ticos do arroz Tulaipanji

Este livro trata dos vários aspectos da variação de SNPs/Indels nas linhas de descendência (Tulaipanji x Ranjit) e dos recursos genéticos do arroz selvagem Oryza rufipogon. Os germoplasmas de arroz foram descritos com base em propriedades morfo-físico-químicas análise GCMS SEM de grãos e grânulos de amido. A tecnologia TILLING/Eco-TILLING baseada na genética inversa foi ilustrada para a extração de alelos. O método GBS baseado em NGS (Illumina) foi utilizado neste estudo para analisar as variações SNP e InDel e o seu padrão de introgressão nas linhas de descendência F5 (P-awn e P-awnless). O número total de SNPs identificados foi de 52.810 e de Indels 4327. Estas variantes não estavam distribuídas uniformemente pelos 12 cromossomas (com base no Golden Helix G Browser). O estudo demonstrou que de um total de 10013 alelos 9252% foram introduzidos em P-awn a partir de Tulaipanji e 7485 a partir de Ranjit; em contrapartida P-awnless transportou 8919% de Ranjit e 1081% de Tulaipanji. Isto deve-se à distorção da segregação. Muitas variações SNP estão associadas a características importantes. Tais como GA20-oxidase (gene sd1) Argonaute e proteína Dicer com domínio PAZ. Ficheiros Fastq de quatro linhas de arroz com NCBI SRA Accession no. SRP077861 SRP077919 SRP077947 & SRP077977.