A exposição crónica a resíduos de pesticidas mesmo em doses baixas perturba significativamente o microbiota intestinal levando a uma disbiose caracterizada por uma redução >50% das bactérias benéficas (Lactobacillus Bifidobacterium) e uma proliferação de agentes patogénicos (Escherichia/Shigella Clostridium). Este desequilíbrio é acompanhado por uma alteração da produção de ácidos gordos de cadeia curta que conduz a um aumento da permeabilidade intestinal a uma inflamação sistémica e a perturbações metabólicas. Estes mecanismos contribuem para o desenvolvimento de doenças crónicas (obesidade diabetes de tipo 2). Esta revisão analisa o impacto dos pesticidas no microbiota e as suas implicações patológicas salientando a necessidade de uma regulamentação mais rigorosa para proteger a saúde pública.