L'exposition chronique aux résidus de pesticides même à faibles doses perturbe significativement le microbiote intestinal entraînant une dysbiose caractérisée par une réduction >50 % des bactéries bénéfiques (Lactobacillus Bifidobacterium) et une prolifération de pathogènes (Escherichia/Shigella Clostridium). Ce déséquilibre s'accompagne d'une altération de la production d'acides gras à chaîne courte favorisant une perméabilité intestinale accrue une inflammation systémique et des perturbations métaboliques. Ces mécanismes contribuent au développement de maladies chroniques (obésité diabète de type 2). Cette revue analyse l'impact des pesticides sur le microbiote et leurs implications pathologiques soulignant la nécessité de renforcer la réglementation pour préserver la santé publique.