Durch die Verbesserung der Leistungsfähigkeit von Computern hat sich die Molekülmodellierung zu einer leistungsstarken Technik in der computergestützten Chemie entwickelt deren praktischer Nutzen stetig zunimmt. Derzeit können wir mithilfe effektiver Algorithmen und leistungsstarker Prozessoren Systeme mit Tausenden von Atomen über mehrere Mikrosekunden simulieren. Die Balance zwischen Rechenaufwand und zuverlässigen Ergebnissen zu finden bleibt jedoch eine Herausforderung. Zwei allgemeine Ansätze helfen uns das Verhalten dieser Systeme aufzudecken: Quantenmechanik und Molekulardynamik-Berechnungen. Die Molekulardynamik (MD) untersucht die Bewegung einer Gruppe von miteinander wechselwirkenden Atomen Molekülen oder Partikeln. MD kann experimentell beobachtbare Größen aus der Dynamik des Systems extrahieren indem sie die Bewegung des Systems untersucht.
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