Épidémiologie moléculaire et diversité génétique des norovirus

La gastro-entérite infantile aiguë touche chaque année plus de 700 millions d'enfants de moins de cinq ans et provoque environ 187 million de décès ce qui représente 12 % des décès d'enfants dans le monde. Les pathogènes viraux figurent parmi les causes les plus courantes de gastro-entérite infantile et le norovirus est l'une des principales causes des épidémies sporadiques de diarrhée chez les adultes et les enfants de moins de cinq ans. L'objectif de cette étude était de détecter et de caractériser la variabilité génétique des norovirus dans des échantillons fécaux provenant de cas de gastro-entérite infantile. Le dépistage a été effectué à l'aide d'un test immuno-enzymatique et les échantillons positifs ont été soumis à un génotypage par RT-PCR à un séquençage partiel du génome et à une analyse phylogénétique. Au total 975 échantillons fécaux ont été analysés ce qui a donné 144 échantillons positifs (147 %). La prévalence du norovirus était plus élevée que celle du rotavirus (12 %) précédemment caractérisée dans ces échantillons. Il n'y avait pas de tendance saisonnière liée à l'infection à norovirus.