Per Altmann (2010) nel sistema no-tillage le perdite di nutrienti sono significativamente inferiori rispetto all'agricoltura convenzionale. È possibile fertilizzare il sistema produttivo per sfruttare al meglio le colture più reattive; inoltre si raccomanda di aumentare la fertilizzazione per le colture che hanno le maggiori risposte ad essa ed esplorare l'effetto residuo del suolo.Nel no-tillage si utilizza la rotazione delle colture in cui la cover crop precede la coltura estiva principale con la possibilità di fertilizzare il sistema e non solo la coltura principale. Parte del fertilizzante viene applicato prima dell'impianto alla coltura di copertura che sarà essiccata e di conseguenza questi nutrienti torneranno alla coltura principale (EMBRAPA 2003).