L'uso di agenti antimicotici è essenziale nel trattamento delle micosi soprattutto nei pazienti immunocompromessi. Tuttavia l'aumento della resistenza sta compromettendo l'efficacia dei trattamenti a causa di mutazioni genetiche dell'attivazione di pompe di efflusso e della formazione di biofilm. Di fronte a questa sfida è fondamentale intensificare la sorveglianza epidemiologica e migliorare i metodi di rilevamento. Le prospettive per combattere la malattia includono l'ottimizzazione delle terapie combinate lo sviluppo di nuove molecole mirate ai meccanismi di virulenza dei funghi e la promozione di un uso più razionale degli agenti antimicotici per prevenire l'emergere di nuove resistenze.