Różnorodność genetyczna i patologiczna izolatów czerwonej zgnilizny w Bangladeszu

Czerwona zgnilizna jest najbardziej niszczycielską chorobą trzciny cukrowej w Bangladeszu i powoduje poważne straty finansowe dla plantatorów trzciny cukrowej. Badanie przeprowadzono w celu scharakteryzowania izolatów Colletotrichum falcatum z trzciny cukrowej zebranych z różnych regionów Bangladeszu na podstawie cech morfologicznych i molekularnych. Sekwencje czterech genów a mianowicie wewnętrznego transkrybowanego fragmentu (ITS-rDNA) β-tubuliny aktyny i dehydrogenazy glakeraldehydo-3-fosforanowej (GAPDH) wykazały 99-100% podobieństwo do sekwencji genów konserwowanych w bazie danych GenBank. Analiza filogenetyczna czterech genów wykazała że izolaty C.falcatum z Bangladeszu były skupione w tym samym kladzie i nie różniły się geograficznie od izolatów z innych krajów. Markery ISSR określiły niską różnorodność genetyczną izolatów C. falcatum w Bangladeszu. Poziomy wirulencji 41 izolatów C. falcatumodpowiadające reakcji chorobowej na roślinie żywicielskiej podzielono na trzy główne grupy: wirulentne umiarkowanie wirulentne i najmniej wirulentne. Siedmiu gospodarzy różnicowych trzciny cukrowej sklasyfikowano jako odpornych umiarkowanie odpornych i podatnych.