Sekwencja insercyjna Mycobacterium tuberculosis IS6110 metodą PCR- RFLP

Gruźlica (TB) jest główną przyczyną śmierci na świecie spowodowaną przez Mycobacterium tuberculosis (M. tb). Według WHO gruźlica zabija 5000 osób dziennie i około trzech milionów osób rocznie. Częstość występowania gruźlicy w Pakistanie rośnie z dnia na dzień. Pojawienie się szczepów MDR M. tb jest bardzo niepokojące z epidemiologicznego punktu widzenia. Oporność M. tb na antybiotyki wynika z mutacji w niektórych genach. W tym badaniu mutacje związane z opornością na etambutol (EMB) określono za pomocą analizy RFLP. Badano zmiany w pozycjach kodonowych 306 i 497 genu embB. IS6110 jest elementem insercyjnym który występuje wyłącznie u członków kompleksu M. tuberculosis (MTBC) i działa jako ważne narzędzie diagnostyczne w identyfikacji tych gatunków. DNA wyekstrahowano z kultury M. tb i poddano trawieniu enzymem restrykcyjnym PvuII. Następnie zbadano wzór RFLPs za pomocą Southern blotting w celu sprawdzenia różnorodności. Liczba kopii IS6110 różni się u tych izolatów. Izolaty M. tb z blisko spokrewnionych obszarów wykazują więcej podobieństw w porównaniu z izolatami z odległych obszarów.