Sequenciação de ADN

O adenocarcinoma do cólon é o tipo mais comum de cancro gastrointestinal. Por conseguinte foi efectuada a sequenciação do ADN de fragmentos de cADN numa linha celular Caco-2. Esta experiência foi realizada para encontrar potenciais marcadores biológicos da célula cancerosa ou do enterócito normal que podem ser úteis no diagnóstico da doença. A sequenciação do ADN foi efectuada utilizando o método de terminação de cadeia com ddNTPs marcados e a sua leitura por um sequenciador de ADN (Beckman Coulter CEQ 2000). Das 11 sequências obtidas com sucesso 5 fragmentos adquiridos corresponderam parcialmente a sequências de ADN humano e revelaram que os genes completos aos quais estes fragmentos pertencem codificariam 3 proteínas humanas diferentes. Estas proteínas são Guanine Nucleotide-Binding Protein Subunit Beta-2-Like 1; Chromodomain Helicase DNA Binding Protein 4; e Centromere protein J. Verificou-se que contribuem ou inibem os fenótipos cancerígenos das células o que pode ser explicado pela quantidade de proteínas na célula e pelo nível de mutações que possuem. Esta investigação revela a necessidade de mais investigação sobre linhas celulares cancerígenas e a sua sequenciação de ADN.