Sequenciação e caraterização genética

A banana (género Musa) é uma importante cultura económica e alimentar. As plantas de bananeira são atacadas por muitos agentes patogénicos bacterianos fúngicos e virais. Um dos agentes patogénicos virais mais importantes da bananeira é o Banana bunchy top virus (BBTV) que causa a doença do topo do cacho da bananeira (BBTD). Na Índia a indústria da banana tem enfrentado o problema do BBTV desde o final da década de 1980 quando uma grave epidemia causou perdas económicas drásticas. O genoma do BBTV compreende pelo menos seis componentes integrais de moléculas circulares de ADN de cadeia simples (cssDNA) cada uma com cerca de 1 Kb de tamanho. O BBTV pertence ao género Babuvirusin Nanoviridae uma das três famílias de vírus de cssDNA. É transmitido pelo pulgão preto da bananeira Pentalonia nigronervosa Coq. As informações sobre o BBTV em Kerala são limitadas. É extremamente importante isolar e caraterizar o vírus que infecta as culturas de banana em Kerala. Para caraterizar o BBTV de Kerala o ADN-R de um isolado de vários distritos de Kerala foi amplificado por PCR clonado e sequenciado. A análise dos componentes genómicos do ADN-R revelou subgrupos de BBTV em Kerala. Com base no DNA-R os isolados de Kerala pertencem ao subgrupo do Pacífico Sul.