Sequenza di inserzione IS6110 del Mycobacterium tuberculosis mediante PCR-RFLP

La tubercolosi (TB) è la principale causa di morte nel mondo causata dal Mycobacterium tuberculosis (M. tb). Secondo l'OMS la TB uccide 5000 persone al giorno e circa tre milioni di persone all'anno. Il tasso di prevalenza della TB è aumentato di giorno in giorno in Pakistan. L'emergere di ceppi MDR di M. tb è motivo di grande preoccupazione epidemiologica. La resistenza di M. tb agli antibiotici è dovuta a mutazioni in alcuni geni. In questo studio le mutazioni associate alla resistenza all'etambutolo (EMB) sono state determinate attraverso l'analisi RFLP. Sono state analizzate le alterazioni nelle posizioni dei codoni 306 e 497 del gene embB. IS6110 è un elemento di inserzione che si trova esclusivamente all'interno del membro del complesso M. tuberculosis (MTBC) e funge da importante strumento diagnostico nell'identificazione di queste specie. Il DNA è stato estratto dalla coltura di M. tb e sottoposto a digestione mediante l'enzima di restrizione PvuII. Quindi sono stati studiati i pattern RFLP utilizzando il Southern blotting per verificare la diversità. Il numero di copie di IS6110 varia in questi isolati. Gli isolati di M. tb provenienti da aree strettamente correlate mostrano più somiglianze rispetto agli isolati di aree distanti.