Transformacja chloroplastów wzbudziła duże zainteresowanie w kontekście produkcji szczepionek w roślinach. Wyrażanie antygenów szczepionkowych poprzez chloroplasty ma wiele zalet. Przyjazność dla środowiska możliwość wielokrotnego wyrażania transgenów precyzja integracji transgenów i brak efektów epigenetycznych to główne zalety transformacji plastydów. Ze względu na ograniczenia ekonomiczne w dostępności szczepionek przeciwko chorobom zakaźnym konieczne jest opracowanie ulepszonych szczepionek które będą bardziej skuteczne i opłacalne a tym samym łatwo dostępne dla większości pacjentów w krajach o ograniczonych zasobach.