Traitement numérique des images cytogénétiques pour la classification

Nous présentons le développement d'un outil bioinformatique qui permet la détection de nucléoïdes d'ADN (avec tête et queue) en fluorescence par reconnaissance d'image pour leur classification ultérieure selon la technique du test des comètes. L'objectif est d'automatiser et de gérer leur stockage et d'optimiser les processus dans le laboratoire de cytogénétique. À cette fin les méthodes possibles à appliquer sont évaluées et celles qui combinent des algorithmes mathématiques et informatiques des réseaux neuronaux et des systèmes neuro-flous sont sélectionnées. La méthode développée effectue la détection et la segmentation selon les étapes suivantes :Un prétraitement et une segmentation initiale de l'image brute sont effectués. Les fragments obtenus sont classés par des réseaux neuronaux en trois groupes : tête queue et fond. Enfin les têtes ou noyaux et les queues sont mesurés et ré-analysés en les classant en fonction de leur rapport. Ce processus de détection de segmentation et de classification a été testé au moyen d'une étude de cas avec des images cytogénétiques dans un essai de comètes du Laboratoire de cytogénétique générale et de surveillance environnementale de l'Institut de biologie subtropicale UNaM-IBS-CONICET.