A procalcitonina pode ser utilizada para distinguir entre infeção bacteriana e viral do trato respiratório e para determinar a duração do tratamento com antibióticos para o diagnóstico e monitorização de doentes com sépsis e choque sético e para estimar o seu prognóstico para monitorizar a resposta ao tratamento com antibióticos para detetar infecções em doentes pós-cirurgia e pós-transplante de órgãos em doentes com queimaduras graves insuficiência de múltiplos órgãos e traumatismos graves para o diagnóstico de sépsis em todas as idades incluindo doentes neutropénicos para o diagnóstico diferencial de meningite bacteriana versus meningite viral e para o diagnóstico de artrite séptica para a deteção de envolvimento renal em crianças que sofrem de infecções do trato urinário.
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