A epidemia de VIH no Paquistão caracteriza-se por uma elevada prevalência de UDI e de trabalhadores do sexo masculinos e transexuais mas uma prevalência muito baixa de mulheres trabalhadoras do sexo. A maioria das mulheres adquiriu o VIH dos seus maridos. Dos 556 refugiados afegãos 59% eram seropositivos 368% portadores de VHC e 917% portadores de VHB. De 396 MTSW 116% eram seropositivos 207% HCV e 76% eram HBV positivos. Entre os 28 seropositivos afegãos 17 eram do subtipo A1 05 estavam alinhados com o CRF 01_AE (CRF 01_AU) e 06 com o 02_AG. Dos 33 VIH do MTSW 21 eram do subtipo A1 02 eram G e 10 eram CRF 01_AE. Todas as estirpes do subtipo A1 e CRF 01_AE apresentam uma homologia muito próxima (efeito fundador). O presente estudo registou pela primeira vez os subtipos G a forma recombinante circulante (CRF) 01_AE e a CRF 02_AG. Os outros VIH eram do subtipo A 62% CRF 01_AE 25% CRF 02_AG 10% e subtipo G 3%. Contrariamente à opinião anterior de que o VIH no Paquistão era uma epidemia monofilética trazida por trabalhadores expatriados que regressavam dos Estados do Golfo a deteção de vários subtipos provou que a epidemia de VIH no Paquistão é um evento polifilético e que os VIH de diferentes partes do mundo estiveram envolvidos na rápida propagação do VIH no amplo espetro clínico e na resposta altamente variável à TAR.
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