VIH VHC et VHB chez les réfugiés afghans et les travailleurs du sexe masculins et transsexuels

L'épidémie de VIH au Pakistan se caractérise par une forte prévalence chez les consommateurs de drogues injectables et les travailleurs du sexe masculins et transsexuels mais par une très faible prévalence chez les travailleuses du sexe. Sur 556 réfugiés afghans 59 % étaient séropositifs pour le VIH 368 % pour le VHC et 917 % pour le VHB. Sur 396 travailleurs du sexe 116 % étaient séropositifs 207 % avaient contracté le VHC et 76 % le VHB. Parmi les 28 Afghans séropositifs 17 étaient du sous-type A1 05 étaient alignés sur le CRF 01_AE (CRF 01_AU) et 06 sur le 02_AG. Sur les 33 VIH de MTSW 21 étaient de sous-type A1 02 de type G et 10 de type CRF 01_AE. Toutes les souches du sous-type A1 et le CRF 01_AE présentent une homologie très proche (effet fondateur). La présente étude a signalé pour la première fois des sous-types G la forme recombinante circulante (CRF) 01_AE et la CRF 02_AG. Les autres VIH étaient le sous-type A à 62 % la CRF 01_AE à 25 % la CRF 02_AG à 10 % et le sous-type G à 3 %. Contrairement à l'opinion antérieure selon laquelle le VIH au Pakistan était une épidémie monophylétique apportée par les travailleurs expatriés de retour des pays du Golfe la détection de plusieurs sous-types a prouvé que l'épidémie de VIH au Pakistan est un événement polyphylétique et que des VIH provenant de différentes parties du monde ont été impliqués dans la propagation rapide du VIH.